Badanie Megapanel PBI/Gemius opiera się na unikalnej na skalę światową metodologii, łączącej właściwości badania typu user-centric (badanie panelowe) z badaniem typu site-centric (wyniki badania gemiusTraffic monitorującego ruch na witrynach internetowych). Metodologia jest efektem prac koncepcyjnych, badawczych i analitycznych zespołu specjalistów PBI i Gemius.

Podstawowym źródłem informacji o odwiedzanych witrynach, używanych aplikacjach oraz czasie korzystania z internetu w badaniu Megapanel PBI/Gemius jest kilkunastotysięczny panel użytkowników internetu, stanowiący miniaturę polskiej społeczności internautów. Informacje te łączone są z danymi demograficznymi internautów. Skład panelu jest dopasowywany do pochodzącej z sondażowego badania strukturalnego struktury demograficznej polskich użytkowników Internetu.

Wyniki badania panelowego są uzupełniane danymi z badania site-centric. Połączenie obu typów badań umożliwia pełną prezentację informacji o ruchu internetowym oraz o profilach społeczno-demograficzych internautów na analizowanych serwisach.

Badanie rozpoczyna się wypełnieniem kwestionariuszy rekrutacyjnych na komputerach użytkowników internetu, wybranych metodą losowania systematycznego oraz pobraniem i zainstalowaniem programu netPanel, który gromadzi wyłącznie dane dotyczące odwiedzanych przez panelistę stron internetowych, czasu spędzanego w sieci oraz nazw aplikacji uruchomionych na komputerze. Użytkownik, który wypełni kwestionariusz i zainstaluje na komputerze program, staje się uczestnikiem panelu. Dane o odwiedzalności witryn prezentowane są w formie bezosobowych zestawień statystycznych. Działanie programu netPanel nie obciąża komputera w stopniu odczuwalnym i jest niezauważalne dla użytkownika.

Badanie spełnia wszystkie zalecenia kodeksu ESOMAR, wyznaczającego zasady prowadzenia badań rynkowych. Wprowadzone zostały procedury chroniące anonimowość badanych osób i określające zasady uczestnictwa w badaniu nieletnich internautów. Uczestnictwo w badaniu jest dobrowolne i każdy panelista może z niego w dowolnej chwili zrezygnować.